വിജ്ഞാന കേന്ദ്രമായി പരിലസിച്ചിരുന്ന ഇവിടം അടിമവംശ സ്ഥാപകനായിരുന്ന അലാവുദ്ദീന് ഖില്ജിയുടെ സേനാനായകന് മൊഹമ്മദ് ബക്തിയാര് ഖില്ജിയാണ് ആക്രമിച്ചു കീഴടക്കിയത്. 1197 ല് നളന്ദ തകര്ക്കപ്പെട്ടതോടെ ഇന്ത്യയില് ബുദ്ധമതത്തിന് ഒരു തിരിച്ചുവരവ് ഉണ്ടായില്ല. പക്ഷേ, നളന്ദയില് നിന്ന് പകര്ന്ന് കിട്ടിയ വിജ്ഞാനം ചൈനയും കൊറിയയും ജപ്പാനുമടക്കമുള്ള വിദേശരാജ്യങ്ങളിലെ ബുദ്ധമതാനുയായികള് കാലം കെടുത്താത്ത തിരിനാളമായി കൊണ്ടുനടക്കുന്നു.