വാഗേയകാരന് കൂടിയായിരുന്നു അദ്ദേഹം. വാഗീശ്വരീ വരദേ.. (ഭൂഷാവലി രാഗം), അമ്മേ വരദായിനി.. (ധന്യാസി രാഗം), ധര്മ്മവതീ കൃപാവതീ... (ധര്മ്മവതീ രാഗം) എന്നീ കൃതികള് പ്രധാനമാണ്.
പ്രഭാകര വര്മ്മയ്ക്ക് ദൈവം അറിഞ്ഞു കൊടുത്ത സിദ്ധിയായിരുന്നു സംഗീതം. പന്ത്രണ്ടാം വയസ്സില് ചെങ്ങന്നൂര് മഹാദേവ ക്ഷേത്രത്തില് ശ്രീപാര്വതീ ദേവിയുടെ മുമ്പിലായിരുന്നു അദ്ദേഹത്തിന്റെ അരങ്ങേറ്റം.
പഠനത്തില് കേമനല്ലായിരുന്ന അദ്ദേഹത്തെ മോശം വിദ്യാര്ത്ഥിയായാണ് അക്കാലത്ത് കണക്കാക്കിയിരുന്നത്. ചില ക്ലാസുകളില് ഒന്നിലേറെ പഠിക്കുകയും ചെയ്തു. പക്ഷെ, സംഗീതം പഠിച്ചപ്പോള് ഉയര്ന്ന റാങ്കോടെയായിരുന്നു വിജയം.
1928 ഒക്ടോബര് 29 ന് എ.ആര്.രാജരാജ വര്മ്മയുടെ മകള് മാവേലിക്കര വലിയ കൊട്ടാരത്തിലെ ചന്ദ്രപ്രഭാ അമ്മ തമ്പുരാട്ടിയുടെയും കിളിമാനൂര് കൊട്ടാരത്തിലെ രാമവര്മ്മ തമ്പുരാന്റെയും രണ്ടാമത്തെ മകനാണ്. അവിവാഹിതനായിരുന്നു.
ദി വീക്കിന്റെ മുന് എഡിറ്റര് സുരേന്ദ്രവര്മ്മ, സുമംഗല പ്രതാപ വര്മ്മ, രമണി കേരളവര്മ്മ, വാസന്തി സ്വാമിനാഥന് എന്നിവര് സഹോദരങ്ങളാണ്. മാവേലിക്കര വീരമണി ഭാഗവതരുടെയും മാവേലിക്കര രാമനാഥന്റെയും കീഴില് സംഗീതത്തിന്റെ ബാലപാഠങ്ങള് അഭ്യസിച്ചു.
കൊട്ടാരങ്ങളിലും ക്ഷേത്രങ്ങളിലും നടന്നിരുന്ന സംഗീത കച്ചേരികളും നാദസ്വര കച്ചേരികളുമാണ് അദ്ദേഹത്തില് കുട്ടിക്കാലത്ത് സംഗീത താത്പര്യം ഉണര്ത്തിയത്. ഒരിക്കല് അദ്ദേഹത്തിന്റെ തോഡി രാഗാലാപനം കേട്ട് നാദസ്വര ചക്രവര്ത്തി രാജരത്നം അത്ഭുതപ്പെട്ടു.